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近日，中国农业年夜学动物科学技能学院张浩传授、张博副传授团队于国际期刊Advanced Science发表研究论文《年夜范围基因组研究展现藏鸡三来历祖源与高原顺应的分层演化机制》（Large-Scale Genomics Reveals Three-Source Ancestry and Layered Adaptation to High Altitude in Tibetan Chickens）。研究整合1054份全基因组数据，体系解析了藏鸡高原顺应历程中“祖源从哪里来、什么时候进入高原、沿何种路径扩散、别离孝敬哪些顺应性功效”的要害科学问题，展现了人类介导的群体迁徙与高原情况选择配合塑造藏鸡遗传布局的新机制。

青藏高原持久处在低氧、低暖和强紫外辐射等极度情况压力之下。藏鸡作为顺应高原情况的主要处所家禽资源，具备优良的低氧耐受能力，是研究家养动物高原顺应机制的主要模子。此前研究已经发明一批与藏鸡低氧顺应相干的候选基因及心理通路，但藏鸡是否由单一祖源逐渐顺应高原，还有是由差别来历群体于差别汗青期间连续汇入并配合介入顺应性塑造，仍缺少体系回覆。

针对于这一问题，研究团队将藏鸡高原顺应的形成历程拆解为祖源布局、时间条理、空间扩散及功效模块四个彼此跟尾的研究层面，构建了藏鸡高原顺应遗传基础的总体注释框架。

三类祖源配合组成藏鸡高原顺应的遗传底盘

于祖源布局层面，研究团队起首经由过程群体遗传布局阐发发明，西藏地域藏鸡并不是一个均一群体，而是出现出较着的区域遗传分解特性。进一步联合祖源建模及群体汗青揣度，研究职员辨认出藏鸡基因组中不成约简的三类祖源来历：西北中国来历祖源（Northwest China，NWC）、川滇毗邻区域来历祖源（Sichuan–Yunnan Adjacent region，SYA）及南喜马拉雅山麓来历祖源（Southern Himalayan Foothills，SHF）。

研究注解，三类祖源其实不是简朴并列存于，而是配合构成了藏鸡高原种群的遗传底盘。此中，NWC代表更深层的奠定性祖源，SYA及SHF则别离从东南边向及南部标的目的向高原种群输入新的遗传身分。研究团队进一步验证发明，对于藏鸡多个亚群而言，三来历模子均可以或许更好注释其遗传构成，申明藏鸡高原顺应并不是来历在单一群体的伶仃演化，而是多来历遗传身分持久会聚的成果。

三来历祖源模子示用意

从古老奠定到近期交流：藏鸡祖源出现四重时间条理

于时间条理方面，研究团队进一步使用局部祖源辨认、祖源片断长度漫衍及混淆时间揣度等要领，对于差别祖源进入藏鸡基因组的汗青挨次举行解析。

成果显示，藏鸡的祖源组成具备清楚的时间分层特性。NWC祖源组成最深层的奠定底盘，其成立时间早在928个世代，即距今至少约1392年；SHF祖源保留了一次较古老但强度较低的输入旌旗灯号，约发生在928个世代之前；SYA祖源则对于应一次范围较年夜的相对于近期扩张，约发生在514个世代之前，即距今约771年。

于此基础上，研究团队进一步辨认出藏鸡群体形成历程中的四重时间条理：起首是NWC组成的深层奠定祖源；其次是较初期的SHF输入；随后因此SYA为代表的主要扩张与交流阶段；末了是近几十年至数百年间连续存于的品种间交流旌旗灯号。

这一成果注解，藏鸡高原顺应其实不是一次性完成的遗传事务，而是于持久汗青历程中，由差别祖源于差别时间阶段慢慢叠加形成的演化成果。差别汗青期间进入高原的遗传身分，配合介入了今天藏鸡种群布局及顺应性特性的塑造。

时间分层模子图

注：藏鸡三来历祖源进入高原种群的时间分层模式。差别祖源于差别汗青阶段连续汇入，配合形成藏鸡高原顺应的遗传基础。

两条扩散路径出现差别空间布局

于空间布局层面，研究团队进一步追踪了差别祖源于青藏高原和其周边区域的扩散方式。成果显示，来自川滇毗邻区域的SYA祖源及来自南喜马拉雅山麓的SHF祖源，其实不因此不异方式进入并扩散至高原内部。

SYA祖源体现出较为较着的“节点式、阶梯式”扩散特性。其遗传影响由川滇毗邻区域向高原内部慢慢递减，但于部门高原节点群体中呈现累积征象，提醒这一扩散历程可能与沿河谷、交通节点及人群交流形成的阶段性流传路径有关。

比拟之下，SHF祖源则出现出越发持续、光滑的扩散模式。其遗传身分由南喜马拉雅山麓标的目的逐渐向高原内部渗入，切合沿南部高原通道连续扩散的空间特性。

与此同时，作为深层奠定祖源的NWC身分于阔别外来祖源输入中央的高原内部群体中相对于富集，与SYA及SHF祖源形成互补性的空间漫衍格式。

研究显示，藏鸡群体的空间布局不仅反应了天然情况樊篱及地舆间隔的影响，也提醒了汗青期间人类迁徙、商业交流及家禽携带流传对于高原家养动物遗传组成的主要作用。

三类祖源别离联系关系差别顺应性功效模块

于功效模块层面，研究团队进一步存眷差别祖源是否携带了具备差异化作用的顺应性遗传身分。思量到繁杂群体汗青可能造成近似选择旌旗灯号的遗传差异，研究职员起首基在最优人口汗青模子构建中性模仿配景，对于候选选择区域举行严酷校订，并联合通路富集阐发及纯合片断阐发举行多层验证。

研究发明，三类祖源所孝敬的候选顺应性功效出现出较着的模块化分工特性。

此中，NWC祖源相干候选区域重要富集在血液轮回稳态、血小板黏赞同凝血调控等功效模块，代表基因包括 VWF 及 TSPAN9。这些功效可能有助在藏鸡于高原低氧前提下维持氧运输及血管稳态。

SYA祖源相干候选区域重要触及钙旌旗灯号调控及代谢调治等功效模块，代表基因包括 CACNA2D1 及 AMY2A。这些基因可能与心脏功效、能量使用以和生长代谢性状相干。

SHF祖源相干候选区域则与血汗管调控及肺血管重塑等功效模块相干，此中 AGTR1 是较具代表性的候选基因，提醒南部来历祖源可能于高原低氧情况下的肺轮回顺应历程中阐扬作用。

值患上留意的是，研究还有发明部门候选基因于差别祖源路径中配合呈现。例如，TSHR 于三类祖源比力中均被辨认，CACNA2D1 则同时呈现于SYA及SHF相干旌旗灯号中。这申明藏鸡高原顺应既具备差别祖源间的功效互补，也可能存于多条遗传路径配合作用在要害心理历程的征象。

研究团队指出，这些成果展现的是差别祖源与功效模块之间的统计联系关系，为后续开展候选基因功效验证、高原顺应性状解析及资源使用研究提供了主要基础。

功效互补与选择旌旗灯号图

注：三类祖源相干候选区域出现功效模块化分工：NWC偏重血液与血管稳态，SYA偏重钙旌旗灯号与代谢调治，SHF偏重心肺轮回相干功效。

多来历、分阶段、模块化配合塑造藏鸡高原顺应

该研究初次从年夜范围基因组层面将藏鸡的祖源来历、进入时间、扩散线路及顺应性功效接洽起来，提出藏鸡高原顺应是一个“多来历输入、分阶段叠加、空间路径分解、功效模块互补”的动态形成历程。

这一发明不仅深化了对于藏鸡高原顺应遗传机制的熟悉，也为理解家养动物怎样于天然选择与人类勾当配合作用下顺应极度情况提供了新的研究范式。研究成果对于在藏鸡优秀种质资源掩护、顺应性基因挖掘以和高原家禽精准育种具备主要参考价值。

该研究获得国度重点研发规划项目（2023YFF1002600）、中国高校科学基金项目（2025TC06七、2025TC135）及中国农业年夜学“2115人材成长规划”资助。论文第一作者为赵宗仪，张博副传授及张浩传授为论文通信作者。研究事情由中国农业年夜学动物科学技能学院牵头，并获得西藏自治区有关单元及云南农业年夜学等互助单元的撑持。